做阴毛种植手术可能会有一定的并发症：
1、阴部神经损伤：手术程度深达肌层，若切口过深，有造成神经损伤的可能。
2、感染发炎：术中消毒不当或有菌操作等均有可能导致感染和发炎症状。
3、出血：术中若处理不当，有可能引发出血。
做阴毛种植手术可能还会伴随一定的副作用。外形不佳：毛发移植过程中若移植过度或不够都会影响术后眉毛的整体外形。
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阴部脱毛后遗症：
1、毛囊炎：可能发生毛囊炎。若合并感染，可能会导致化脓，甚至形成肉芽肿。
2、感染加重：如果造成微小的皮肤创口，会使病原菌易于种植;另一方面，若身体某个部位已存在感染，例如金黄色葡萄球菌、化脓性葡萄球菌、绿脓杆菌、HPV、HSV、传染性软疣等，把病原体带到所及之处。已有感染的人，不应该进行阴毛种植，至少也应等感染痊愈再尝试。
3、接触性皮炎：修复产品都有可能导致刺激和过敏，引发接触性皮炎。
阴毛种植手术的风险并不是很高，可能存在有感染，阴蒂头坏死，但是阴毛种植手术的风险都并不是很高，所以可以放心进行手术，只要选择正规的医院和专业的医生，以及进行恰当的术后护理，就可以避免风险。
阴毛种植也是选取的头部毛囊，它是利用环形钻在后枕部供发区钻取毛发，种植后无明显的线形瘢痕，但会遗留小的点状痕迹，且移植毛囊前需暂时剔短后枕部头发，介意者需提前考虑。此方法在获取毛囊单位时损伤毛发相对较多，一次移植毛发的量相对较少，难以达到大量阴毛种植的需求，且阴毛种植者需要多次手术。
